Les archives de la FMH se composent de la Correspondenzblatt für die Schweizer Ärzte (de 1872 à 1919) et du Bulletin des médecins suisses (à partir de 1920). Jusqu’en 2001, les différents numéros du Bulletin des médecins suisses ont été reliés en livres d’archive. Depuis 2002, les numéros peuvent être consultés en ligne mais chaque numéro est aussi archivé en version imprimée. Depuis 2006, les revues paraissent en deux versions linguistiques distinctes avec le Schweizerische Ärztezeitung et le Bulletin des médecins suisses. Il est dés­ormais aussi prévu de relier les numéros du Schweizerische Ärztezeitung (à partir de 2002) et du Bulletin des médecins suisses (à partir de 2006) pour les archi­ver.