Die Jahre zwischen 2006 und 2012 waren für die FMH prägend. Das Bundesgesetz über die Medizinalberufe (MedBG) von 2006 hatte den Rahmen neu definiert, und die FMH musste auf mehreren Feldern gleichzeitig reagieren: in der Weiterbildungspolitik, in der Digitalisierung und in der Tariflandschaft.